環境污染是盤式干燥機的一個比較嚴重的問題。河流常被作為冷卻循環水，造成生物體碎渣進到盤式干燥機與工程建筑層，減少導熱系數。另一個普遍的問題是限度，它是由沖積物的化合物。
環境污染產生時，液體通換熱器，和殘渣的液體沉積到管的表層。沉積這種顏色可造成：
盤式干燥機的經常應用；
經常性清理盤式干燥機；
減少液體的速率越過換熱器；
在盤式干燥機的規格；
環境污染減少了熱應遷移的橫截面積和造成的摩擦阻力提升，在盤式干燥機的熱遷移。這是由于污漬層傳熱系數低。這減少總體導熱系數和換熱器高效率。這相反，很有可能會致使在抽和維護保養成本上升。